中文摘要:由于转基因作物的数量和类型越来越多,因此基于实时PCR方法(qPCR)的转基因作物分析变得越来越复杂和费力。目前,已有学者提出用下一代测序(NGS)方法替代qPCR方法,但常规分析中还未见应用。本研究中,我们开发了一种对转基因生物序列的NGS reads数进行预测的统计学框架,并利用纯转基因大米、加工转基因大米或10%转基因/非转基因大米混合食品等实验数据对该框架进行验证。最后,作者将该统计框架应用于转基因作物样本的常规分析中,来研究NGS用于转基因作物常规分析的可行性。
外文关键词:NGS;GMO detection;Bioinformatics;GM rice;Statistical framework;Processed food
作者:Willems, Sander;Fraiture, Marie-Alice;Deforce, Dieter;等
作者单位:Sci Inst Publ Hlth WIV ISP
期刊名称:FOOD CHEMISTRY
期刊影响因子:4.052
出版年份:2016
出版刊次:2
点击下载:一种基于下一代测序的转基因生物检测的统计学框架