中文摘要：背景：本文基于全基因组测序（WGS）技术和地理元数据分析了2012年美国大规模爆发的食源性疾病流行事件中沙门氏菌的来源，此次事件的发生与从印度进口的金枪鱼有关。方法：试验从食用不同来源金枪鱼相关食品的病人体内分离了100个巴雷利沙门氏菌菌株，应用下一代技术进行全基因组测序。通过构建虚拟地球的系统进化关系将病原基因组与地理区位链接，建立数据传输网络。结果：全基因组测序的系统发生学分析揭示了所分析的菌株源于同一个发源地，这表明马里兰岛和纽约的病人所感染的巴雷利沙门氏菌来源于印度同一个生产商。结论：研究结果表明，全基因组分析提高了对食源性疾病事件中病原菌的鉴定和病原追溯能力。
外文摘要：Background. Using a novel combination of whole-genome sequencing (WGS) analysis and geographic metadata, we traced the origins of Salmonella Bareilly isolates collected in 2012 during a widespread food-borne outbreak in the United States associated with scraped tuna imported from India.
外文关键词：Salmonellosis；geographic information systems；next generation sequencing;single nucleotide polymorphism；traceback
作者：Hoffmann, Maria；Yan Luo；Monday, Steven R.等
作者单位：美国马里兰大学
期刊名称：Journal of Infectious Diseases
期刊影响因子：6.344
出版年份：2016
出版刊次：4
点击下载：美国食源性疾病爆发事件中巴雷利沙门氏菌的来源追踪