中文摘要：本发明属于土壤微生物学技术领域，公开了一种基于深度测序检测玉米根际土壤微生物的方法及系统，采集根际土壤；从土壤中提取高质量微生物基因组DNA；用双标签引物做PCR扩增DNA中16S rDNA V4区, 构建文库；对合格文库进行测序，得到纯净READS；5.拼接，每样品产出至少5.0万条有效TAG用于聚类成可操作分类单元；6.物种组成、结构、多样性及相对丰度差异显著性分析；7.准确测定转基因耐盐碱玉米根际土壤原核微生物群落组成、结构、多样性、相对丰度。本发明受国家转基因重大专项课题“转基因玉米小麦大豆环境安全评价技术(2016ZX08011003)”支持。
外文摘要：NOVELTY - Detecting microorganisms in maize rhizo-sphere based on deep sequencing comprises extracting 16S rDNA V4 region in the microbial metagenomic DNA from the soil samples of transgenic saline-alkali corn-growing areas, amplifying by double-tag fusion primer pairs, building deep sequencing of qualified libraries to obtain pure READS, splicing into TAG, and producing at least 50,000 potential TAGs for clustering into operational taxa OTUs by soil samples.    USE - The method is useful for detecting microorganisms in maize rhizo-sphere based on deep sequencing.    DETAILED DESCRIPTION - An INDEPENDENT CLAIM is also included for system for detecting microorganisms in rhizo-sphere soil of maize based on deep sequencing. 
主权项：一种基于深度测序检测玉米根际土壤微生物的方法，其特征在于，所述基于深度测序检测玉米根际土壤微生物的方法包括： 用双标签融合引物对做PCR扩增转基因耐盐碱玉米种植区土壤样品中提取的微生物宏基因组DNA中的16S rDNA V4区，构建文库； 对合格文库进行深度测序，得到纯净READS； 拼接成TAG，土壤样品产出至少5.0万条有效TAG用于聚类成可操作分类单元OTU。
申请号：CN201711257675.4
专利号：CN107904296A
公开/公告号：CN107904296A
申请/专利权人：东北农业大学;
发明/设计人：曾兴; 刘显君; 王康; 邸宏; 王振华
分类号：C12Q1/6869
主分类号：C12Q1/6869
法律状态：实质审查
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